A la fin du siècle dernier et au début de ce siècle, le Schapendoes néerlandais se rencontrait partout aux Pays-Bas où il y avait des landes et des troupeaux de moutons. Les bergers appréciaient son ardeur infatigable au travail et son intelligence. Il appartient au groupe disparate des chiens de troupeau à poil long et à face très poilue et ébouriffée. Il est apparenté au Bearded-Collie, au Puli, à l’Owczarek Nizinny, au Bobtail, au Briard, au Bergamasque et au Caniche à moutons allemand dans les variétés telles qu’on les rencontre en Hesse, dans l’Odenwald et dans la région du Bas-Rhin. Toutes ces races apparentées sont des mutations en réduction de chiens de type « montagne ». Le créateur de cette race est le cynophile P.M.C. Toepoel. Pendant la seconde guerre mondiale, il sut faire naître de l’intérêt pour cette race pratiquement disparue. Entre 1940 et 1945, on se borna à faire de l’élevage avec les quelques sujets qui existaient encore dans le pays.
Dès 1945, on commença à reconstruire sérieusement la race. Le Club de race du Schapendoes néerlandais a été fondé en 1947 et, en 1952, le Raad van Beheer a accepté provisoirement la race. Le standard a été fixé en 1954 et, dès lors, les chiens sont inscrits dans un livre des origines. L’acceptation définitive eut lieu en 1971 et, dès ce jour, seuls les chiens inscrits sont admis à l’élevage.